少年三国志2的后续玩法中新增了多个挑战性关卡，主要集中在历史战役重现和联盟战争两大方向。历史战役挑战活动还原了赤壁之战、官渡之战等经典场景，每个战役包含3-5个阶段性关卡，玩家需根据敌方阵容调整策略。联盟战争则引入跨服地图，包含出生州、资源州等区域，每个区域设有独立攻防关卡，需联盟成员协作占领。
新增关卡的核心机制围绕时空之力和英雄牌展开。在时空外传类关卡中，玩家需收集时空之力强化属性，通过SL机制反复尝试最优增益组合。英雄牌则用于招募或强化武将，需在策略对决赛等PVP活动中积累。部分关卡如凤鸣百里设计了隐藏宝箱，探索全图可解锁额外奖励，但需注意战力门槛，避免无效消耗体力。
关卡难度分层明显，低阶关卡侧重基础阵容搭配，高阶关卡则考验实时战术调整。例如八卦奇阵关卡需优先击杀异士单位，而乱世英雄征活动要求玩家灵活切换减怒、控制类武将。平民玩家建议优先完成银币副本、寻宝等必做任务积累资源，再挑战高难度关卡。
赤金夏侯渊、千幻左慈等新武将拥有元素变身机制，在低血量或首次释放必杀技时触发满血复活，适合持久战关卡。紫金华佗的回春技能可针对高爆发关卡提供续航，但需注意其防御属性短板。兵符选择上，地刺符的强控效果仍是平民通关首选。
后续关卡设计更注重策略深度与社交协作，玩家需平衡资源投入与战力提升节奏。定期参与限时活动是获取关卡专属奖励的关键，同时需关注武将、兵符的版本适应性调整以确保通关效率。
